本学系于1990年创办，根据医学影像学学科发展的需要和未来社会对医学影像学专门人才的要求，不断进行医学影像学教学体系改革研究与实践，积极探寻适应新形势下的医学影像学教育模式，尝试建立一套以复合型综合能力和创造性自主能力培养为核心的教学体系。经过特色专业建设、课程体系改革、精品课程建设、教材建设、课件建设、重点实验室建设和教学名师培养等一系列教学改革措施。医学影像学专业核心、学位课程放射诊断学在2000年获江苏省教育厅普通高校一类优秀课程基础上，2002年放射诊断学获江苏省研究生培养创新工程研究生优秀课程、2003年获江苏省研究生培养创新工程研究生开放课程、2006年获准东南大学精品课程、2008年获江苏省成人教育精品课程、2010年放射诊断学获准江苏省精品课程和国家级精品课程。医学影像学专业学位课程介入放射学2008年获江苏省研究生培养创新工程研究生优秀课程。东南大学医学影像学专业2006获准江苏省特色专业、2008年获准江苏省成人教育特色专业。在2006年网上中国大学排行榜列为全国68家有影像医学专业院校的专业第2名。该专业2010年获准江苏省品牌专业、国家级特色专业建设，其教育质量在国内享有盛誉，成为国内公认的教育质量高且具有鲜明特色的专业。

学系于1990年招收医学影像学专业五年制本科生，1984年开始招收硕士研究生，2003年获“医学影像与核医学博士点”，成为江苏省首家同类专业博士点。目前本专业在校本科生150余人，硕士生37人，博士生24人，承担教学课时2000余学时/年，承担教学课题11项。已获江苏省教学成果一等奖2项，出版专著、教材45部，总字数600余万字。

目前，学系已形成了一支高学历、结构合理、富有活力的学术梯队。专业师资力量雄厚，教师责任感强、团结协作精神好,学历结构、年龄结构、学缘结构合理，充分发挥了知识的接力及更新作用。其中，博导3人，硕导17人，在国外取得博士学位/博士后或进修1年以上者5人。中青年教师/医师的硕士率90%，博士率50%。

本学系以介入放射学、分子影像学、临床放射诊断学、核医学肿瘤治疗学、医学图像三维处理与临床应用等为主要研究方向，并已形成了显著的学科技术特色与优势。其中，分子影像学和介入放射学在国内占有重要地位和影响力。近五年，完成/在研省部级以上课题62项，其中包括国家自然基金项目19项（其中重点项目2项），国家973计划4项，国家863计划4项，欧洲放射学会基金1项，欧盟-亚洲联合项目1项，总经费2000余万元。获省部级以上科研成果奖11项，其中包括：国家科技进步二等奖1项，中华医学科技二等奖1项，省科技进步二等奖5项。发表论著300余篇，其中SCI收录45余篇（IF>5.0有8篇)，SCI引用数百次，《中华》系列期刊72篇。

2001年被遴选为江苏省卫生厅“135医学重点学科”，2004年被评为“江苏省医学影像质量控制中心”挂靠单位；2006年被评为江苏省政府“十一五”规划重点学科；2007年获准江苏省“科教兴卫”医学重点学科，2007年“分子影像与功能影像”实验室获准江苏省重点实验室。学科带头人滕皋军教授为卫生部有突出贡献中青年专家，中华医学会放射学学会常务委员，中华医学会介入放射学组组长，江苏省放射学会主任委员，教育部教学指导委员会委员及江苏省10名“优秀医学重点学科带头人”之一，并入选江苏省医学领军人才。

近五年，主办国内学术大会3次，继续教育学习班20余次，承办国内学术会议10余次，与会人数达5000余人次；邀请国外学者来院讲座20余人次，聘任客座教授5人；学科有9人次应邀在国际会议或医学中心作特邀讲座，30余人次参加国际会议并作报告。此外，学科还与Leuven大学、Cornell Weill Medical College、Daihouse大学等多家国际著名院校建立了较稳定的合作关系，并开展了实质性的合作研究工作。